感染性疾病科是医院临床一级科室，科室成立于 2005 年，目前已发展成为具有一定规模、技术实力强的我县感染性疾病诊断、治疗、预防中心。感染性疾病科设有独立的发热门诊、结核门诊、住院病区。科室拥有支气管镜、无创呼吸机、有创呼吸机、电除颤仪等先进医疗设备。

科室开展各种结核病的诊治，特殊结核病人的个体化诊治，对肺结核空洞、支气管结核开展支气管镜介入治疗，采用多种药物联合治疗肺结核大咯血。开展各型病毒性肝炎、肝硬化、重症肝炎、酒精性肝病的诊治，肝功能异常病因的鉴别诊断及治疗；开展手足口病、麻疹、水痘、流行性腮腺炎、恙虫病、流行性感冒、肠道感染性疾病等传染病的诊治，开展发热、出疹性疾病的鉴别诊断。

内镜中心拥有先进的医疗设备，包括奥林巴斯支气管镜等。

开展支气管镜检查、支气管镜镜下治疗、支气管镜镜下肺泡灌洗术、支气管镜联合X-pert检查；对感染性疾病科常见疾病进行规范化治疗；常规开展重症结核、呼吸衰竭、发热待查、肝硬化、肝衰竭等危重疑难疾病诊治。其中支气管镜检查、支气管镜镜下治疗（APC、球囊扩张术等）、支气管镜镜下肺泡灌洗术、支气管镜联合X-pert检查等内镜诊疗技术处于州领先水平。